LI-8100/A土壤碳通量自動(dòng)測量系統在設計上充分考慮了采樣地點(diǎn)和采樣時(shí)間上的差異性，當使用8100-104/C長(cháng)期測量室，實(shí)驗人員可以根據自己的實(shí)驗要求設定LI-8100/A測量系統的采樣間隔，然后儀器將會(huì )自動(dòng)進(jìn)行測量。在數據采集間隔時(shí)間，測量室的上蓋將會(huì )自動(dòng)打開(kāi)，移動(dòng)至測量土壤部分的旁邊，這樣一方面保證了大氣CO2和土壤室內的空氣進(jìn)行交換，另一方面保證測量土壤的外界環(huán)境不受干擾，如風(fēng)速、降雨和光照等等。
當LI-8100/A與LI-8150多路器聯(lián)合使用時(shí)，LI-8100/A可以控制多達16個(gè)長(cháng)期測量室。同時(shí)還可以使用8100-102或8100-103短期調查室，調查室可以快速在不同地點(diǎn)測量土壤碳通量，并且調查室也可以在無(wú)人看管的情況下自動(dòng)采樣，但調查室更加適合中短期測量。因此，LI-8100/A的上述設計滿(mǎn)足了測量不同時(shí)間和地點(diǎn)的要求。
下圖是平均采樣數量和由于地點(diǎn)不同造成的誤差對應圖，該誤差范圍波動(dòng)從5% - 100%。上述誤差計算根據標準的統計學(xué)理論，具體計算過(guò)程見(jiàn)后面描述。
即使比較相對一致的土壤，變異系數（CV）為10％（相對來(lái)說(shuō)，農業(yè)實(shí)驗田地一致程度更高），如果測量誤差是5％，那么根據上圖，需要至少測量15 ~ 16個(gè)數據。如果測量土壤的變異系數更大，則需要增加采樣數量。
對于一些調查，即使使用16個(gè)長(cháng)期測量室也不可能準確獲得某一地塊的平均碳通量。為了降低實(shí)驗費用，一些研究人員建議調查室提高時(shí)間分辨率來(lái)彌補長(cháng)期室的這種不足(Savage and Davidson, 2003; Arnold, et.al, 2006)。
眾所周知，被測土壤的溫度、濕度等等環(huán)境因子的日變化互相關(guān)聯(lián)，并且該地點(diǎn)的碳通量日變化與這環(huán)境因子呈現相似的日變化，因此使用的調查室可以用來(lái)推測碳通量的日變化。研究人員可以使用該方法建立環(huán)境因子變化（如太陽(yáng)輻射、空氣溫度、降雨量等等）和碳通量變化之間的模型，以及獲得整個(gè)地塊的平均碳通量。
確定樣本大小
標準誤，σ?，（標準差）與總的群體標準差，σ，關(guān)系：
σ? = σ/√n
n是某個(gè)樣地的采樣數量。對于一個(gè)呈正態(tài)分布的群體，在95％置信區間內，真實(shí)平均值 μ、整個(gè)群體的算術(shù)平均值，應該在下面的范圍之內：
? ± （2σ/√n）
其中?是取樣平均數。一般說(shuō)來(lái)，（2σ/√n）≤可接受的標準誤，尤其是：（2σ/√n）≤ μ ×可接受相對誤差
因此：
√n ≥2σ / （μ ×可接受相對誤差）
變異系數（CV）為σ/μ，因此：
n ≥ （2 CV / 可接受相對誤差）2
如上面舉例：CV = 10%，可接受的相對誤差為0.05，則：
n = (2 * 0.1 / 0.05)2 = 16
即至少要采集16數據才能代表整個(gè)樣地的碳通量。References
Savage, K. and Davidson, E. A., 2003. A comparison of manual and automated systems for soil CO2 flux measurements: trade-offs between spatial and temporal resolution. Journal of Experimental Botany, 54(384): 891-899.
Arnold, Kira, Jay Ham, Clenton Owensby and Patrick Coyne, 2006. Temporal stability of soil respiration in tallgrass prairie: towards watershed-scale estimates of carbon fluxes. Abstract, ASA-CSSA-SSSA 2006 International Meeting, 231-14.