又到了收獲的季節,相信您手上已經(jīng)有了一堆光合數據等待分析。這不,我們技術(shù)部最近也總是接到LI-6400XT或LI-6800光合儀的用戶(hù)來(lái)電,詢(xún)問(wèn)怎么通過(guò)軟件去分析數據。關(guān)于這個(gè)問(wèn)題,很多文獻都有提及。在一些方法中,只需用到氣體交換(Gas Exchange)的數據,而一些還需要聯(lián)合使用葉綠素熒光的測量參數。下面,小編就二氧化碳響應曲線(xiàn)和光響應曲線(xiàn)和模型擬合軟件資源做了一個(gè)匯總。
二氧化碳響應曲線(xiàn)FvCB模型(Farquhar, von Caemmerer & Berry 1980)擬合
1 EXCEL軟件(Sharkey,2015)
http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/pce.12641/full
2 SAS軟件(Dubois et al., 2007)
http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/j.1469-8137.2007.02182.x/full
3基于網(wǎng)絡(luò )的“雙重優(yōu)化”方法(Gu et al., 2010)
http://leafweb.ornl.gov
結合使用氣體交換和葉綠素熒光數據
1 EXCEL(Bellasio et al., 2015)
http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/pce.12560/full
2 EXCEL(Mouleau-Ngangue et al., 2017)
http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/nph.14260/full
3 其他資源
1. Excel spreadsheet http://www.life.illinois.edu/bernacchi/links.html
2. Excel spreadsheet http://landflux.org/Tools.php
3. R code https://sites.google.com/site/fridleylab/home/protocols (需要翻墻)
光響應曲線(xiàn)擬合模型
1 Excel(Lobo et al., 2013)
http://link.springer.com/article/10.1007%2Fs11099-013-0045-y
其他軟件資源
1 R https://sites.google.com/site/fridleylab/home/protocols (需要翻墻)
2 EXCEL http://landflux.org/Tools.php
參考文獻:
Farquhar G.D., Von Caemmerer S. & Berry J.A. (1980) A biochemical model of photosynthetic CO2 assimilation in leaves of C3 species. Planta 149, 78-90.