關(guān)于光合作用中的CO2響應曲線(xiàn)和光響應曲線(xiàn)的擬合軟件方法

      氣體交換系統測量指標能夠告訴我們光合作用潛在的限制過(guò)程和誤差來(lái)源。研究最多的兩種光合作用響應曲線(xiàn)是A/Q（光響應曲線(xiàn)）和A/Ci（CO₂響應曲線(xiàn)）。
 
光合作用光響應曲線(xiàn)
光合作用光響應曲線(xiàn)A/Q描述的是光強與光合生物凈光合速率間的關(guān)系，通過(guò)該曲線(xiàn)可以得出各種生理參數（表觀(guān)光量子效率（AQE）、最大凈光合速率（Pn）、光飽和點(diǎn)（LSP）、光補償點(diǎn)（LCP）、暗呼吸速率（Rd）等），這些參數是各種尺度植物生理生態(tài)學(xué)過(guò)程研究的基礎。
 
A/Ci響應曲線(xiàn)
A/Ci響應曲線(xiàn)是指在穩定的葉片與空氣水蒸汽壓差下，光合速率和蒸騰速率隨CO₂濃度的改變而變化的響應曲線(xiàn)。在飽和光強下，Rubisco酶的最大催化速率（Vc,max），RuBP的最大再生速率（Jmax）和磷酸丙糖的運輸速率（VTPU）被認為是限制光合作用的主要因素。Farquhar等人(1980)所提出的模型提供了一種通過(guò)A/Ci響應曲線(xiàn)（CO₂響應曲線(xiàn)）來(lái)區分光合作用生化因素限制和氣孔因素限制的檢測方法?，F在，可通過(guò)同時(shí)檢測葉綠素熒光使這種分析方法進(jìn)一步擴展得到一種活體檢測用于光合作用的能量和用于光呼吸的能量的方法，使得在葉肉中，生化限制因素和CO₂擴散限制因素得以區分。
 


很多LI-6400/XT的用戶(hù)反饋：希望能有一個(gè)軟件來(lái)擬合光合的FvCB模型(Farquhar, von Caemmerer & Berry 1980)。實(shí)際上，有很多的文獻和方法使用該模型擬合曲線(xiàn)，但目前沒(méi)有專(zhuān)門(mén)的商業(yè)軟件包來(lái)實(shí)現這一功能。但是借用當前的一些免費統計軟件完全可以擬合光合FvCB模型，請見(jiàn)以下分享，用戶(hù)可以選擇這些模型來(lái)擬合自己的實(shí)驗數據。
 
但在此特別聲明：LI-COR公司及北京力高泰科技有限公司并沒(méi)有驗證過(guò)這些方法，請各位科研人員根據自己的實(shí)驗和經(jīng)驗去選擇適合您的模型！
 

使用FvCB模型擬合CO₂響應曲線(xiàn)
同行評議的文獻
1.   Microsoft Excel 電子表格（ Sharkey et al.）
地址：http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/j.1365-3040.2007.01710.x/full

2.   SAS 程序（Dubois et al., 2007）
地址：http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/j.1469- 8137.2007.02182.x/full

3.   基于網(wǎng)頁(yè)的詳盡的雙重優(yōu)化方法（Gu et al., 2010）
地址：http://leafweb.ornl.gov
 
其它擬合方法
1.   Microsoft Excel 電子表格- http://www.life.illinois.edu/bernacchi/links.html

2.   Microsoft Excel 電子表格 - http://landflux.org/Tools.php

3.   R 程序 - https://sites.google.com/site/fridleylab/home/protocols
 
擬合光響應曲線(xiàn)

同行評議的文獻
1.   Microsoft Excel 電子表格（ Lobo et al.）
地址：http://link.springer.com/article/10.1007%2Fs11099-013-0045-y

其它擬合方法
1.   R 程序 - https://sites.google.com/site/fridleylab/home/protocols
2.   Microsoft Excel 電子表格 - http://landflux.org/Tools.php 

參考文獻
Farquhar G.D., Von Caemmerer S. & Berry J.A. (1980) A biochemical model of photosynthetic CO₂ assimilation in leaves of C3 species. Planta 149, 78–90.